More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0868 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 319 aa  634    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  76.7 
 
 		 316 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  76.7 
 
 		 316 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  76.7 
 
 		 316 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  68.44 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  48.97 
 
 		 308 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  50.17 
 
 		 313 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  48.95 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  41.67 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  43.26 
 
 		 292 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  42.01 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 290 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  42.34 
 
 		 290 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 		 290 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  41.99 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  43.38 
 
 		 292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  36.88 
 
 		 293 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  41.75 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  43.38 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  40.91 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  40.79 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  41.4 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  41.05 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  39.93 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  40.7 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  39.15 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  41.16 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  40.79 
 
 		 292 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  39.71 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  39.26 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  37.33 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 		 294 aa  202  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  42.24 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  40.88 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  40.81 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  42.29 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  39.35 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  38.51 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  36.64 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  42.22 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  41.85 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 293 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  38.89 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  37.68 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  37.81 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  37.81 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  37.81 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>