More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0854 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  58.37 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.87 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  56.33 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  47.23 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  47.23 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.75 
 
 		 232 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3656  two component transcriptional regulator  42.91 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  47.15 
 
 		 250 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.86 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  45.19 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  43.57 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.8 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  43.57 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  43.57 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  43.22 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  43.7 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  42.32 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  51.04 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  39.58 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.39 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  39.26 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  38.27 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  41.77 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  37.86 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  39.08 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.18 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.08 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  40.43 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.41 
 
 		 231 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.23 
 
 		 320 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.08 
 
 		 222 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  39.43 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.82 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  40.08 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 225 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 236 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.13 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  37.76 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3500  response regulator receiver  57.6 
 
 		 356 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0435  two component transcriptional regulator  38.11 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.583358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  36.33 
 
 		 229 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  38.82 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  36.33 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  38.62 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  38.82 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  36.6 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.44 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  39.92 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  38.82 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  40.33 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>