More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0770 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  100 
 
 
397 aa  757    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  63.86 
 
 
387 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  60.61 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  60.57 
 
 
423 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  54.12 
 
 
393 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  51.51 
 
 
406 aa  348  9e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  52.25 
 
 
422 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  51.3 
 
 
435 aa  333  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  50.92 
 
 
415 aa  330  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  51.78 
 
 
409 aa  328  8e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  53.41 
 
 
412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  51.39 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  50 
 
 
391 aa  315  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.27 
 
 
397 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  49.73 
 
 
377 aa  295  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  45.43 
 
 
398 aa  294  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  51.67 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  47.26 
 
 
391 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  60.92 
 
 
465 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  48.97 
 
 
414 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  49.85 
 
 
425 aa  269  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  60.25 
 
 
416 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  43.18 
 
 
382 aa  249  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  55.28 
 
 
397 aa  248  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  52.65 
 
 
402 aa  245  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  43.08 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  53.56 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  47.04 
 
 
410 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
443 aa  242  7.999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  52.99 
 
 
392 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  52.99 
 
 
392 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  52.59 
 
 
392 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  46.51 
 
 
394 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  51.54 
 
 
397 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 
401 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  39.8 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  48.28 
 
 
257 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  50.6 
 
 
483 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  47.39 
 
 
347 aa  189  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
458 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
592 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
581 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
584 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
582 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
584 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
587 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
556 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  36.77 
 
 
587 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  36.25 
 
 
587 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
585 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  36.45 
 
 
587 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  36.45 
 
 
587 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  36.45 
 
 
587 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  36.45 
 
 
587 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  36.45 
 
 
587 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
585 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
431 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
444 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  36.45 
 
 
587 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  36.45 
 
 
587 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 
429 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  42.86 
 
 
352 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
482 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
489 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
453 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
587 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  43.57 
 
 
537 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
596 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
589 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  45.45 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
460 aa  173  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
401 aa  172  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
591 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  40.61 
 
 
599 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
581 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 
377 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
346 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  41.6 
 
 
346 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  41.8 
 
 
591 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
437 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
453 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  34.22 
 
 
346 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  38.95 
 
 
433 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  40.7 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  40.73 
 
 
584 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  39.02 
 
 
581 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  38.27 
 
 
575 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
815 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
599 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
478 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  38.89 
 
 
554 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
608 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
554 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  34.94 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  39.78 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>