More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0769 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 232 aa  454  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  60.99 
 
 		 224 aa  245  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  59.81 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  55.36 
 
 		 222 aa  231  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  56.54 
 
 		 219 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  51.17 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  48.13 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  46.01 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  52.02 
 
 		 222 aa  187  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  45.62 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  45.62 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  45.07 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  46.95 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  47.14 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  42.99 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  44.86 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  44.75 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.19 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  42.72 
 
 		 219 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  42.99 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.79 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  44.86 
 
 		 220 aa  158  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  35.87 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  42.06 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.65 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  41.7 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  41.7 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  41.7 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  41.31 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  40.37 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  39.91 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  37.04 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  41.78 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  41.55 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  38.32 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  38.03 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  34.74 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  38.16 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  32.59 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  27.85 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  35.45 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  30.95 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  26.64 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  30.45 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.03 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.03 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  33.01 
 
 		 253 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  32.94 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  33.04 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  33.49 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  30.58 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  26.39 
 
 		 214 aa  99  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  33.14 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  30.17 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  26.39 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  33.48 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  30.17 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  25.12 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  32.57 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  31.84 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  31.47 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  30.04 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.47 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  31.22 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.9 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  33.5 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  30.66 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 220 aa  95.5  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  27.85 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  29.09 
 
 		 242 aa  95.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  32.99 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>