51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0618 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  628  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  39.39 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  37.25 
 
 
365 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  38.43 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  42.41 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  36.29 
 
 
403 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  40.94 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  38.34 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  40.08 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  36.52 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  38.1 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  31.16 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  39.29 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  33.46 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  37.41 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  35.64 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  35.89 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  35.29 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1298  chromosome partitioning ATPase  40.95 
 
 
232 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  42.15 
 
 
569 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  32.44 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0119  hypothetical protein  34.85 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  35.56 
 
 
359 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  38.33 
 
 
353 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  34.48 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  38.33 
 
 
353 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  34.33 
 
 
352 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.34 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  35.8 
 
 
353 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  41.94 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3423  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
407 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  32.87 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2778  flp pilus assembly protein FlpE  40.62 
 
 
229 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  hitchhiker  0.0000109666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  31.97 
 
 
537 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  32.7 
 
 
405 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1875  putative CpaE protein  32.7 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2042  putative fimbriae assembly-related protein  32.7 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1678  putative CpaE protein  32.7 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0334  putative fimbriae assembly-related protein  32.7 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1887  putative CpaE protein  32.7 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0827  putative CpaE protein  32.7 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3930  response regulator receiver protein  32.68 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555789  normal  0.301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  35.37 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.86 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  30.4 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  24.79 
 
 
413 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.67 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  31.71 
 
 
260 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  31.89 
 
 
389 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.75 
 
 
212 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>