46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0527 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  587  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4023  hypothetical protein  66.12 
 
 
317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  52.3 
 
 
319 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  49.67 
 
 
333 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  48.52 
 
 
306 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  41.86 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2924  hypothetical protein  41.25 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  53.33 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  43.25 
 
 
297 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  32.1 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  35.53 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  35.02 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  35.02 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  30.69 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  30.69 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  30.69 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  35.02 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  30.23 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  31.16 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  35.26 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  29.32 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  27.68 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  32.81 
 
 
262 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.18 
 
 
286 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.18 
 
 
286 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  33.9 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  33.9 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  33.9 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.17 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  27.55 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  31.4 
 
 
424 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  28.78 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  32.35 
 
 
297 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  31.58 
 
 
280 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  30.65 
 
 
259 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  30.57 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  33.11 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  29.69 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  33.82 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  34.69 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  31.22 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1394  hypothetical protein  29.78 
 
 
295 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  32.92 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  30.1 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21980  hypothetical protein  29.45 
 
 
331 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  32.28 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>