77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0521 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  39.66 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 230 aa  94  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.12 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  37.3 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 224 aa  84.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  28.42 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  35.33 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.16 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  34.68 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  33.71 
 
 		 213 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  32.26 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  29.66 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  33.55 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  30.63 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  29.33 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  31.89 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  35.2 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  33.14 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  31.69 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  32.37 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  30.82 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  32.09 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  18.75 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  28.34 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  18.75 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 118 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 133 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  38.54 
 
 		 114 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0660  ArsR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 96 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410209  normal  0.0250069 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0002  regulatory protein ArsR  43.86 
 
 		 92 aa  45.1  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 		 280 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 113 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 111 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0945  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  44.26 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0495  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  30.97 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 103 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  39.24 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  44.64 
 
 		 121 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 108 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 113 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 109 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 110 aa  41.6  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  28.25 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  50.88 
 
 		 124 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 		 118 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 105 aa  41.2  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  36.07 
 
 		 113 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5706  hypothetical protein  37.04 
 
 		 295 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  46.27 
 
 		 120 aa  41.2  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 98 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 115 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>