More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0516 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
244 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.02 
 
 
244 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  57.38 
 
 
240 aa  251  8.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
245 aa  188  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.11 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
238 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
250 aa  175  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
238 aa  175  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
237 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
239 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
248 aa  168  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
244 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.57 
 
 
257 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
241 aa  158  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
241 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
245 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
246 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  40.33 
 
 
245 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
247 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
233 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
260 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
227 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
246 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
263 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
245 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
252 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
246 aa  138  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
242 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
265 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
239 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
250 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
272 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.81 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
250 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  41.8 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 
237 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
249 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
240 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
229 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  35.43 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 
236 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 
236 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  34.96 
 
 
309 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  40.4 
 
 
255 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
237 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
254 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
254 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  34.02 
 
 
251 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.19 
 
 
258 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
261 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  29.91 
 
 
236 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
253 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0978902  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
254 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  33.2 
 
 
247 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
244 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
256 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
281 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
248 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
261 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
236 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
276 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
236 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
236 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1665  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.62 
 
 
256 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
347 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  40 
 
 
276 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.06 
 
 
256 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0379215  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3079  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.06 
 
 
257 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
259 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
276 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
298 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.52 
 
 
246 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3286  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.06 
 
 
256 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
292 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.18 
 
 
258 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
254 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
256 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
227 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
270 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
264 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
206 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
289 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1386  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.62 
 
 
258 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  36.18 
 
 
255 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
280 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 
279 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>