12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0503 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0503  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  24.74 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  26.44 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  38.55 
 
 		 695 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  30.85 
 
 		 785 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  23.77 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32332  predicted protein  32.38 
 
 		 341 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000985525  normal  0.357327 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  21.05 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  26.97 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  27.03 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29310  nucleotide excision repair endonuclease  36.99 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.525257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>