More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0458 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  100 
 
 
288 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  71.67 
 
 
264 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  69.17 
 
 
259 aa  330  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  74.58 
 
 
312 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  74.15 
 
 
255 aa  328  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  73.62 
 
 
302 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  66.38 
 
 
247 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  65.29 
 
 
253 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  60.77 
 
 
256 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  65.24 
 
 
262 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  62.18 
 
 
255 aa  298  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  63.56 
 
 
255 aa  295  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  62.13 
 
 
258 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  61.57 
 
 
266 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  61.8 
 
 
291 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  62.14 
 
 
455 aa  292  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  62.61 
 
 
256 aa  292  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  60.17 
 
 
255 aa  292  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  59.75 
 
 
255 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  61.7 
 
 
250 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  60.08 
 
 
277 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  60.27 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  60.16 
 
 
252 aa  285  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  65.77 
 
 
253 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  58.06 
 
 
258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  62.17 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  65.49 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  62.17 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  63 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.58 
 
 
280 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  58.37 
 
 
271 aa  279  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  62.72 
 
 
261 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  58.47 
 
 
264 aa  278  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.09 
 
 
274 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
279 aa  275  5e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  56.72 
 
 
258 aa  271  8.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  62.21 
 
 
250 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  63.71 
 
 
258 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
244 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  58.72 
 
 
258 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  56.6 
 
 
252 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  59.07 
 
 
247 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  53.45 
 
 
269 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  58.37 
 
 
257 aa  252  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  58.93 
 
 
255 aa  251  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
245 aa  248  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  53.42 
 
 
279 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  55.7 
 
 
243 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.88 
 
 
245 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  54.92 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  52.59 
 
 
266 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  55.23 
 
 
277 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  54.66 
 
 
293 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  54.1 
 
 
243 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
249 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
241 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  51.68 
 
 
253 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  51.3 
 
 
244 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45 
 
 
230 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50.44 
 
 
240 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.62 
 
 
228 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  51.02 
 
 
271 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  54.34 
 
 
272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  59.28 
 
 
249 aa  222  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.26 
 
 
240 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.03 
 
 
269 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.18 
 
 
226 aa  219  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  44.3 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  44.3 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.27 
 
 
225 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  54.5 
 
 
248 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
227 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.73 
 
 
225 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.86 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  44.89 
 
 
252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  44.89 
 
 
252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  47.32 
 
 
241 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  48.86 
 
 
235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  52.27 
 
 
248 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
231 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  48.87 
 
 
231 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
229 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
252 aa  211  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  47.03 
 
 
229 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
252 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  50 
 
 
240 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
229 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.84 
 
 
230 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.26 
 
 
229 aa  208  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  50.91 
 
 
250 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  41.39 
 
 
255 aa  208  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  45.56 
 
 
565 aa  208  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.88 
 
 
233 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  46.29 
 
 
231 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
232 aa  206  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  40.74 
 
 
256 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.82 
 
 
239 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  46.24 
 
 
563 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>