33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0454 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  37.27 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  34.25 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  29.15 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  30.43 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3186  hypothetical protein  27.67 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  29.76 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  26.61 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  26.07 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  26.72 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  26.07 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  26.07 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  26.07 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  26.07 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  26.07 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  26.07 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  26.67 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  26.18 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  32.2 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  26.7 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  26.7 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  32.63 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01305  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0466824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  26.24 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  26.58 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  28.92 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  26.24 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  27.73 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  27.05 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  23.53 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5092  nucleotidyltransferase domain protein  27.54 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5084  nucleotidyltransferase domain-containing protein  27.54 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  25.31 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>