More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0434 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
444 aa  899  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  29.86 
 
 
456 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
423 aa  112  1e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.42 
 
 
458 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.86 
 
 
429 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.09 
 
 
426 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 
442 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  29.57 
 
 
424 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
423 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
425 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.12 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 
429 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
427 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
424 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.32 
 
 
438 aa  93.2  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.22 
 
 
419 aa  93.2  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.91 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
442 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
429 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  4.21461e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
417 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
435 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
429 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 
434 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.67 
 
 
434 aa  86.7  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 
420 aa  86.3  1e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
422 aa  85.9  1e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
419 aa  85.5  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 
419 aa  84.3  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  25.17 
 
 
437 aa  84  4e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  27.05 
 
 
439 aa  84.3  4e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 
454 aa  83.6  6e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 
427 aa  82  2e-14  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
417 aa  82.4  2e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 
478 aa  80.9  4e-14  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.17 
 
 
427 aa  80.9  4e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.6 
 
 
413 aa  80.5  6e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 
455 aa  80.1  7e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.6 
 
 
399 aa  80.1  7e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
414 aa  79.7  8e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.76 
 
 
410 aa  79.7  1e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 
431 aa  79.7  1e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
422 aa  79.7  1e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 
415 aa  78.6  2e-13  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  29.04 
 
 
433 aa  78.6  2e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
429 aa  79  2e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 
433 aa  78.2  3e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
435 aa  78.2  3e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
455 aa  77.8  4e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.91 
 
 
428 aa  77.8  4e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
408 aa  77.8  4e-13  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.92518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
421 aa  76.3  1e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
441 aa  76.3  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.44 
 
 
461 aa  75.9  1e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.64 
 
 
461 aa  76.3  1e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 
424 aa  75.5  2e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.62 
 
 
408 aa  75.5  2e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 
434 aa  75.5  2e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  35 
 
 
423 aa  75.5  2e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
439 aa  75.5  2e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
434 aa  74.7  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  31.37 
 
 
495 aa  74.7  3e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
422 aa  74.7  3e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  1.00934e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
452 aa  74.3  4e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
432 aa  74.3  4e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
427 aa  73.6  7e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 
414 aa  73.2  9e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
450 aa  72.8  1e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.08 
 
 
436 aa  72  2e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
419 aa  71.6  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
470 aa  71.2  3e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
444 aa  71.2  3e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.99953e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
420 aa  71.2  3e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
420 aa  71.2  3e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.85 
 
 
423 aa  71.2  4e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
419 aa  70.9  5e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  8.66815e-05 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.04 
 
 
415 aa  70.9  5e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
435 aa  70.5  5e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.79 
 
 
380 aa  70.9  5e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
419 aa  70.5  6e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 
417 aa  70.5  6e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
427 aa  70.5  6e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
415 aa  70.1  7e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 
419 aa  70.1  7e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 
440 aa  70.1  7e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  34.13 
 
 
419 aa  70.1  8e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 
451 aa  69.3  1e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
415 aa  69.7  1e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
424 aa  69.3  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
415 aa  69.3  1e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
444 aa  69.3  1e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.96 
 
 
441 aa  69.7  1e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
415 aa  69.7  1e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
415 aa  69.3  1e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.36 
 
 
435 aa  69.3  1e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  21.02 
 
 
412 aa  68.6  2e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  25.28 
 
 
420 aa  68.6  2e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 
419 aa  68.9  2e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>