More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0315 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  64.34 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  57.58 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  57.72 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  55.65 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 142 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  52.54 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  53.85 
 
 		 141 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  53.91 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  57.45 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  46.9 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  44.17 
 
 		 144 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  55.88 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  49.11 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.91 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  49.11 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  50.89 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  47.86 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  44.95 
 
 		 262 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  46.43 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  52.53 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  48.15 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 255 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 148 aa  97.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.61 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  48.6 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  45.22 
 
 		 144 aa  95.5  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  49.04 
 
 		 155 aa  94.4  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  45.87 
 
 		 151 aa  94  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  50 
 
 		 134 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  48.51 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 134 aa  90.5  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 261 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.66 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 265 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 281 aa  88.2  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 250 aa  87.8  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  41.12 
 
 		 255 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 305 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  39.68 
 
 		 281 aa  84  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 322 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.83 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 309 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 513 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5551  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 296 aa  78.2  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 300 aa  78.2  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 296 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 296 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  41.3 
 
 		 291 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 306 aa  77.4  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  35.61 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 304 aa  74.7  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 287 aa  74.7  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 266 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1140  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>