More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0287 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  100 
 
 
370 aa  708    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  42.23 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  45.61 
 
 
386 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  47.25 
 
 
396 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 
398 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  44.12 
 
 
399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  45 
 
 
405 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
369 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  38.91 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  41.7 
 
 
423 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
393 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.93 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 
420 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  37.61 
 
 
383 aa  126  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.34 
 
 
786 aa  126  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  39.71 
 
 
385 aa  126  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  45.51 
 
 
364 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  40.69 
 
 
407 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  35.18 
 
 
439 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  39.66 
 
 
386 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  40.09 
 
 
381 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
404 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
359 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  33.59 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.88 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  30.7 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.1 
 
 
726 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  32.87 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.9 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
376 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
389 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  31.88 
 
 
376 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  30.26 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  30.26 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  30.26 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  31.14 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  30.32 
 
 
376 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  30.32 
 
 
376 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
434 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  30.7 
 
 
376 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  30.26 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.23 
 
 
581 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  31.11 
 
 
391 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16240  signal transduction histidine kinase  49.68 
 
 
408 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.429357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.11 
 
 
699 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
363 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
440 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
372 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  37.25 
 
 
413 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.33 
 
 
354 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
388 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 
363 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  23.23 
 
 
363 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  32.35 
 
 
359 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.77 
 
 
351 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
404 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
445 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  35.78 
 
 
367 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
372 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
441 aa  99.8  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
407 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
420 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
421 aa  98.6  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  30.86 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  35.98 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.8 
 
 
458 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
408 aa  97.1  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.79 
 
 
442 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  44.78 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  32.3 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  32.14 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  34.93 
 
 
422 aa  94  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 
363 aa  93.2  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 
392 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.8 
 
 
406 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  28.17 
 
 
430 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
468 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
394 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
382 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.6 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  35.24 
 
 
397 aa  89.4  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>