More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0272 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  76.15 
 
 		 522 aa  682    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 512 aa  982    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  65.06 
 
 		 509 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  64.85 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  59.14 
 
 		 511 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  58.25 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  61.78 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  56.7 
 
 		 508 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  57.73 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  57.98 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  57.98 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  57.98 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  56.14 
 
 		 527 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  58.41 
 
 		 507 aa  475  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  56.62 
 
 		 513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  55.56 
 
 		 539 aa  468  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  52.52 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  56.15 
 
 		 513 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  55.04 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  54.1 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  55.73 
 
 		 537 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  55.29 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  56.05 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  55.6 
 
 		 519 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  48.34 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.52 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  36.42 
 
 		 568 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.16 
 
 		 531 aa  259  7e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  36.61 
 
 		 567 aa  259  8e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.7 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  34.25 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.04 
 
 		 556 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.69 
 
 		 573 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.94 
 
 		 562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.93 
 
 		 610 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.29 
 
 		 573 aa  213  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.05 
 
 		 594 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.93 
 
 		 592 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.19 
 
 		 550 aa  210  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.86 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  31.16 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.18 
 
 		 548 aa  204  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  32.02 
 
 		 547 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.19 
 
 		 573 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  32.05 
 
 		 598 aa  194  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.85 
 
 		 601 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  32.35 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.54 
 
 		 1017 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  33.76 
 
 		 584 aa  186  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  30.26 
 
 		 584 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.69 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  31.21 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  29.63 
 
 		 549 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  30.46 
 
 		 583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.52 
 
 		 582 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.92 
 
 		 588 aa  160  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  29.02 
 
 		 601 aa  159  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.38 
 
 		 583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  32.71 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  31.5 
 
 		 514 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  29.09 
 
 		 530 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  28.21 
 
 		 816 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  29.29 
 
 		 584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  32.85 
 
 		 550 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  35.56 
 
 		 522 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  26.95 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  27.55 
 
 		 803 aa  127  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  28.95 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  28.65 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  28.39 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  33.55 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  28.97 
 
 		 534 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  25.73 
 
 		 719 aa  124  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  33.09 
 
 		 558 aa  123  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  30.84 
 
 		 534 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  27.47 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  28.16 
 
 		 532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  33.26 
 
 		 568 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  32.01 
 
 		 539 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  35.03 
 
 		 558 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  32.94 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  30.04 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  27.65 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  32.95 
 
 		 572 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  29.4 
 
 		 552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  28.28 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  31.22 
 
 		 648 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  27.89 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  31.86 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  29.16 
 
 		 544 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  32.59 
 
 		 541 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  29.43 
 
 		 651 aa  114  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0915  ATP-dependent DNA ligase  32.5 
 
 		 541 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137062  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  28.55 
 
 		 531 aa  113  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  26.05 
 
 		 664 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  31.08 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  31.84 
 
 		 561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  31.45 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  30.56 
 
 		 566 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  31.19 
 
 		 539 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>