More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0261 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
438 aa  829    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  68.54 
 
 
450 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  57.14 
 
 
447 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  58.94 
 
 
449 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  62.79 
 
 
427 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  54.34 
 
 
423 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  56.42 
 
 
423 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  47.09 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  46.17 
 
 
419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 
443 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 
422 aa  260  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  45.01 
 
 
430 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
445 aa  259  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  44.53 
 
 
430 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  42.35 
 
 
426 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  40.54 
 
 
505 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 
426 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  37.73 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 
436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 
443 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 
422 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  42.86 
 
 
343 aa  205  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
426 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  33.26 
 
 
420 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 
422 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  35.87 
 
 
431 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
428 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
445 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.86 
 
 
415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  31.26 
 
 
404 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  31.49 
 
 
404 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  31.29 
 
 
524 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  31.59 
 
 
415 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 
432 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 
432 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  31.5 
 
 
415 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  26.64 
 
 
403 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.25 
 
 
409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  28.67 
 
 
406 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  29.13 
 
 
406 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.35 
 
 
419 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  28.88 
 
 
401 aa  126  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  27.8 
 
 
412 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
412 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  28.6 
 
 
420 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
406 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.92 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  30.98 
 
 
416 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  32.7 
 
 
424 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  29.25 
 
 
421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  30.98 
 
 
429 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  31.33 
 
 
418 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
479 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.48 
 
 
416 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  28.79 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  30.13 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  28.76 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
415 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.4 
 
 
416 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  27.7 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  30.4 
 
 
416 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  27.04 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  28.74 
 
 
411 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  28.12 
 
 
437 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  30.62 
 
 
455 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  30.4 
 
 
416 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  32.14 
 
 
421 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
416 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  30.4 
 
 
416 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  29.5 
 
 
423 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  28.42 
 
 
454 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  28.93 
 
 
408 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
412 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  29.34 
 
 
499 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  29.98 
 
 
428 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
406 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  26.42 
 
 
427 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  26.83 
 
 
424 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.81 
 
 
413 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
408 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  32.32 
 
 
424 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
425 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  29.47 
 
 
432 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
453 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  31.55 
 
 
410 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  26.99 
 
 
407 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  33.59 
 
 
443 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  24.57 
 
 
427 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
433 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.83 
 
 
447 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>