More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0146 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
292 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  55.14 
 
 
287 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12339  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter uspA  57.09 
 
 
290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.65 
 
 
312 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
292 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 
296 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
309 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
316 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
299 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
308 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
309 aa  188  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
303 aa  188  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.11 
 
 
320 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  41.78 
 
 
305 aa  185  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
316 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
309 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
303 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
317 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
307 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  40.56 
 
 
307 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
318 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
308 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.93 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  36.93 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  33.45 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  36.77 
 
 
310 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
306 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.77 
 
 
310 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
297 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
295 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  36.43 
 
 
310 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
310 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  36.43 
 
 
310 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
318 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  36.43 
 
 
310 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
305 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
310 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
310 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
310 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  36.43 
 
 
310 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
319 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
313 aa  175  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 
288 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  36.86 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
316 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
310 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
285 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
316 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
294 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  38.99 
 
 
287 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  33.9 
 
 
321 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  36.71 
 
 
321 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
321 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
299 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
293 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18860  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.86 
 
 
316 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.346815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
293 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
296 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
283 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
311 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
310 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
453 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
318 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
309 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  37.5 
 
 
322 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
290 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
302 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.159905  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
300 aa  165  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.82 
 
 
275 aa  165  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
293 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  hitchhiker  0.000381845 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
298 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
293 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
311 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0656  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  34.49 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3284  maltose-binding periplasmic protein  36.79 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588261  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0618  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>