More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0118 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 285 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  41.43 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  43.08 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  42.55 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.71 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 246 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.5 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.26 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 248 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.09 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.22 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  35.32 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  47.47 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  20.87 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  27.43 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  24.14 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  26.7 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  32.37 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  29.79 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  30.5 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  22.18 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  28.5 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.57 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  21.07 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.64 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  35.63 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  41.98 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2317  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  31.46 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6584  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 112 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  22.8 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  32.03 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>