More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0107 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 126 aa  241  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  54.31 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  54.31 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  52.68 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  53.45 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  51.46 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  49.12 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  60 
 
 		 121 aa  90.5  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 305 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  43.9 
 
 		 554 aa  67.8  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  39.5 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  32.43 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  27.19 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  37.04 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  27.34 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  40.16 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  37.96 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  44.05 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  23.48 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  28.21 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  33.64 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  34.96 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 480 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  27.27 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  27.97 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  30.48 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  38.24 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 470 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  30.48 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 478 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  38.36 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>