More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0085 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0085  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
280 aa  537  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
251 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.47 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.47 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.83 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  38.4 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.9 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.32 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.72 
 
 
370 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.62 
 
 
371 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23.35 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.9 
 
 
368 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23.35 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23.35 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.9 
 
 
368 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.9 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  33.48 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0027  hydrolase, alpha/beta superfamily, CesH  22.73 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.39 
 
 
370 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  26.46 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.77 
 
 
369 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.45 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
266 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.82 
 
 
370 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  36.11 
 
 
341 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  32.23 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  32.23 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  32.23 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.69 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25 
 
 
367 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.92 
 
 
389 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  31.4 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.24 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
312 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.51 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  25.4 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3702  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  24.86 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  24.08 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
279 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.32 
 
 
380 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
270 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.71 
 
 
370 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 
254 aa  55.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  28.57 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  24.48 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 
393 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 
393 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.51 
 
 
393 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0638  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.925346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 
393 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>