132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0067 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  53.79 
 
 
289 aa  300  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.64 
 
 
282 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.59 
 
 
372 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.42 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.94 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.19 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.37 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.53 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.46 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.64 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.13 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  32.82 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.12 
 
 
280 aa  62.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  34.06 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  32.64 
 
 
276 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.14 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  26.17 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  34.39 
 
 
329 aa  59.7  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  25.2 
 
 
354 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  25.2 
 
 
352 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  25.2 
 
 
307 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.26 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.25 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.91 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5986  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.25 
 
 
344 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.51 
 
 
274 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.56 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  33.02 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29154  predicted protein  26.7 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.21 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.57 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59203  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.17 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  28.34 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.04 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  36.45 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  36.45 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  36.45 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  27.81 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  36.45 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  36.45 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.43 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.45 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  36.45 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.66 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.78 
 
 
253 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  26.36 
 
 
300 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.18 
 
 
306 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.63 
 
 
260 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.74 
 
 
302 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  23.02 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  27.54 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3969  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.83 
 
 
382 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5063  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.17 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15519  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  28.03 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.13 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.95 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.52 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  22.41 
 
 
241 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.65 
 
 
304 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  23.83 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  23.83 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36.36 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.68 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.33 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.68 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6819  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.66 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.33 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36.36 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6245  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.83 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154868  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  23.86 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  23.86 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1767  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 
350 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2379  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 
350 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.86 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  23.86 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.82 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.87 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  23.63 
 
 
298 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  24.43 
 
 
276 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.28 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.63 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  27.33 
 
 
263 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.79 
 
 
257 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  35.29 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04647  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01850)  28.47 
 
 
313 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.73 
 
 
259 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.28 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.02 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>