More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0066 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0066  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
286 aa  564  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  40.68 
 
 
279 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.95 
 
 
294 aa  119  5e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.8 
 
 
314 aa  114  2e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.63 
 
 
310 aa  114  2e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.41 
 
 
316 aa  114  2e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.24 
 
 
310 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.19 
 
 
325 aa  110  2e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.06 
 
 
310 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.06 
 
 
310 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.24 
 
 
305 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11757e-05 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.06 
 
 
310 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.36 
 
 
281 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.13 
 
 
309 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.13 
 
 
281 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  3.16606e-07 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.36 
 
 
281 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.36 
 
 
281 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.36 
 
 
281 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.36 
 
 
281 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  27.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.13 
 
 
292 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.27 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.58 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  46 
 
 
291 aa  82.8  7e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  30.2 
 
 
298 aa  82.4  8e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
278 aa  80.5  3e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 
296 aa  80.1  4e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 
430 aa  79.3  6e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 
301 aa  79.3  7e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  9.94716e-07  hitchhiker  6.11237e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  20.16 
 
 
298 aa  78.2  2e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 
775 aa  77.8  2e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.15573e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
274 aa  76.6  4e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  28.45 
 
 
314 aa  76.3  5e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 
293 aa  76.3  5e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
326 aa  75.5  9e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  25.86 
 
 
537 aa  75.1  1e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  23.31 
 
 
282 aa  75.5  1e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 
290 aa  73.9  3e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  41.9 
 
 
336 aa  72.8  5e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  26.52 
 
 
306 aa  72.8  6e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 
278 aa  72.8  7e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  22.64 
 
 
300 aa  72.4  8e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 
519 aa  71.6  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
252 aa  71.6  1e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000110  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.16 
 
 
285 aa  71.6  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
265 aa  71.6  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 
544 aa  71.2  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
299 aa  70.5  3e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 
293 aa  70.5  3e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 
463 aa  70.1  4e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
288 aa  70.1  4e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 
298 aa  69.7  5e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 
313 aa  69.7  5e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  27.69 
 
 
297 aa  69.3  6e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0209  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
238 aa  69.7  6e-11  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  27.27 
 
 
307 aa  69.3  7e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 
188 aa  69.3  8e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 
273 aa  68.9  8e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 
291 aa  69.3  8e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 
303 aa  68.9  9e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 
303 aa  68.9  9e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  26.26 
 
 
529 aa  68.6  1e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
301 aa  68.2  1e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 
322 aa  68.6  1e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 
546 aa  68.2  1e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 
773 aa  68.9  1e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 
296 aa  68.2  2e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.12725e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  34.31 
 
 
301 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3768  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 
297 aa  67.8  2e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
310 aa  67.8  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  42.55 
 
 
297 aa  67.8  2e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
308 aa  67.8  2e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 
306 aa  68.2  2e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  3.09577e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
301 aa  67  3e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  22.73 
 
 
259 aa  67.4  3e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  31.43 
 
 
299 aa  67.4  3e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  32.14 
 
 
301 aa  67.4  3e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  6.88741e-11  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  32.14 
 
 
287 aa  67.4  3e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 
1201 aa  66.6  4e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 
285 aa  66.6  4e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 
766 aa  66.6  4e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
289 aa  67  4e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 
342 aa  66.6  4e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  26.53 
 
 
529 aa  66.6  4e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 
259 aa  66.6  5e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 
289 aa  66.6  5e-10  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
319 aa  66.6  5e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 
291 aa  66.2  6e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0868  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 
336 aa  66.2  6e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
517 aa  66.2  6e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.11836e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
440 aa  66.2  6e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 
295 aa  66.2  6e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 
118 aa  66.2  7e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 
326 aa  65.9  7e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>