66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0057 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 
643 aa  1287    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  67.99 
 
 
643 aa  857    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  42.97 
 
 
647 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  40.06 
 
 
638 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  36.59 
 
 
620 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  37.22 
 
 
620 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  42.04 
 
 
652 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  38.13 
 
 
617 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  37.72 
 
 
628 aa  382  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  39.41 
 
 
643 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  39.63 
 
 
629 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  36.69 
 
 
634 aa  377  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  38.51 
 
 
654 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  36.93 
 
 
636 aa  359  8e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  37.91 
 
 
633 aa  356  8.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  35.02 
 
 
640 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  32.76 
 
 
655 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  33.18 
 
 
656 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  33.49 
 
 
656 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  33.17 
 
 
800 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  33.5 
 
 
667 aa  321  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  33.5 
 
 
659 aa  320  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  32.57 
 
 
656 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  31.95 
 
 
651 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  34.99 
 
 
659 aa  317  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  34.31 
 
 
640 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  31.74 
 
 
651 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  31.59 
 
 
651 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  31.59 
 
 
651 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  31.74 
 
 
651 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  32.1 
 
 
652 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  30.56 
 
 
648 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  32.53 
 
 
648 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  33.54 
 
 
640 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  34.48 
 
 
640 aa  302  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  30.36 
 
 
646 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  33.92 
 
 
634 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  28.91 
 
 
672 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  29.6 
 
 
666 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  30.05 
 
 
673 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  32.12 
 
 
647 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  28.1 
 
 
684 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  27.53 
 
 
665 aa  264  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  29.45 
 
 
680 aa  263  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  31.26 
 
 
648 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  29.86 
 
 
629 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  31.94 
 
 
742 aa  242  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  37.05 
 
 
679 aa  219  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  27.01 
 
 
686 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  31.11 
 
 
397 aa  183  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  25.37 
 
 
614 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  26.7 
 
 
711 aa  61.6  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  23.75 
 
 
1025 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  24.31 
 
 
783 aa  54.7  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  22.91 
 
 
844 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  21.38 
 
 
760 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  22.01 
 
 
955 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  23.12 
 
 
602 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  21.84 
 
 
607 aa  50.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  23.03 
 
 
667 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  20 
 
 
765 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  25.28 
 
 
771 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  22.68 
 
 
846 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  23.26 
 
 
675 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.29 
 
 
641 aa  43.9  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  26.83 
 
 
881 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>