More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0044 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 478 aa  909    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.76 
 
 		 479 aa  355  8.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3012  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  41.56 
 
 		 457 aa  282  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  43.61 
 
 		 498 aa  282  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3681  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.16 
 
 		 474 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  42.79 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 466 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8497  putative transcriptional regulator, GntR family  40.33 
 
 		 481 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 474 aa  247  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 467 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.76 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.41 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  42.51 
 
 		 473 aa  232  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4998  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.434701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5086  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2490  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.39 
 
 		 471 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0316891  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.32 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5379  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 452 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.17 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 		 496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 473 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 511 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.11 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 502 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 502 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 502 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.92 
 
 		 501 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 498 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 502 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 466 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  36.75 
 
 		 502 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.96 
 
 		 494 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 495 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  28.04 
 
 		 466 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 466 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 492 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 562 aa  203  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 466 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4531  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.66 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.601015  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 569 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.84 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.35 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 		 472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 473 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.33 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4809  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.5 
 
 		 508 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.367164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 506 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 506 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 502 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.22 
 
 		 495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 495 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 503 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 490 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  32.8 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.45 
 
 		 515 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  31.42 
 
 		 504 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 466 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.18 
 
 		 492 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  31.59 
 
 		 513 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>