More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0028 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
493 aa  990    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  57.69 
 
 
483 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  56.16 
 
 
489 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.8 
 
 
489 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.33 
 
 
483 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  50.3 
 
 
481 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  49.09 
 
 
485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.2 
 
 
485 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.49 
 
 
480 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  49.09 
 
 
482 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  50.7 
 
 
490 aa  415  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.17 
 
 
485 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  46.26 
 
 
480 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.91 
 
 
493 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  44.6 
 
 
489 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.28 
 
 
487 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  45.38 
 
 
491 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  42.48 
 
 
486 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.6 
 
 
491 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  45.18 
 
 
485 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.71 
 
 
484 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  44 
 
 
491 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  44 
 
 
491 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  44 
 
 
491 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  44.78 
 
 
491 aa  359  5e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.86 
 
 
488 aa  356  3.9999999999999996e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.57 
 
 
486 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  43.08 
 
 
488 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  40.78 
 
 
504 aa  348  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  43 
 
 
495 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  42.54 
 
 
490 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.17 
 
 
481 aa  345  8e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  40.87 
 
 
488 aa  332  8e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  43.31 
 
 
482 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  40.75 
 
 
501 aa  322  9.000000000000001e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  40.7 
 
 
503 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  38.43 
 
 
492 aa  296  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  40.24 
 
 
504 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 
490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  37.84 
 
 
473 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  40.33 
 
 
493 aa  263  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  36.89 
 
 
489 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 
472 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 
470 aa  246  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  37.35 
 
 
461 aa  239  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 
478 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.16 
 
 
924 aa  233  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 
458 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  36.51 
 
 
921 aa  226  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  38.1 
 
 
933 aa  224  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  32.94 
 
 
487 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  32.74 
 
 
487 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  35.71 
 
 
579 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.87 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 
503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  32.16 
 
 
471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.12 
 
 
573 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 
547 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  30.83 
 
 
972 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  36.53 
 
 
570 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  37.85 
 
 
584 aa  204  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  37.37 
 
 
640 aa  199  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  36 
 
 
610 aa  193  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 
954 aa  189  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.13 
 
 
646 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 
577 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
609 aa  176  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 
578 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.87 
 
 
611 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 
643 aa  169  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.02 
 
 
574 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 
662 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  34.14 
 
 
641 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  32.33 
 
 
664 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 
643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 
634 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
651 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  31.91 
 
 
647 aa  160  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.03 
 
 
634 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.26 
 
 
639 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  33.67 
 
 
548 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 
642 aa  159  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.99 
 
 
586 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  31.44 
 
 
701 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  33.57 
 
 
629 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 
628 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 
678 aa  158  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  32.79 
 
 
646 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 
765 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 
765 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  34.35 
 
 
803 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  34.44 
 
 
802 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  34.24 
 
 
615 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  34.44 
 
 
802 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  33.88 
 
 
629 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 
760 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  34.44 
 
 
802 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  34.44 
 
 
802 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  34.35 
 
 
803 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  34.61 
 
 
802 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>