84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0023 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  100 
 
 
276 aa  551  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  54.73 
 
 
268 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  52.94 
 
 
270 aa  245  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  46.22 
 
 
257 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  42.8 
 
 
266 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  42.86 
 
 
412 aa  180  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  42.44 
 
 
238 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  41.59 
 
 
260 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  41.13 
 
 
323 aa  168  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  42.24 
 
 
242 aa  168  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  43.63 
 
 
243 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  44.65 
 
 
234 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  34.85 
 
 
368 aa  159  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  40 
 
 
249 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  43.32 
 
 
218 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  36.44 
 
 
521 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  36.55 
 
 
556 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  35.34 
 
 
298 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  39.46 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  40.39 
 
 
192 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  39.91 
 
 
316 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  35.81 
 
 
229 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  36.79 
 
 
312 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  39.26 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  31.17 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  32.16 
 
 
353 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  33.08 
 
 
286 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  32.59 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  33.79 
 
 
236 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  39.67 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  28.14 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  34.96 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  34.15 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  28.64 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.12 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  27.88 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  38.68 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  27.43 
 
 
205 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  35.14 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  33.08 
 
 
209 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  29.79 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30 
 
 
307 aa  56.2  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.25 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  32.87 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  29.37 
 
 
327 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.74 
 
 
206 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  29.31 
 
 
249 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.23 
 
 
206 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  24.26 
 
 
206 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  25.71 
 
 
336 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.26 
 
 
206 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.43 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.26 
 
 
206 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  30.37 
 
 
302 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  37.23 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  29.01 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  22.22 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  28.06 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  26.09 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  31.52 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  27.36 
 
 
301 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  30.61 
 
 
263 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  26.06 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  23.87 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.22 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  33.66 
 
 
214 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  25 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  28.57 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  31.16 
 
 
354 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  30.43 
 
 
298 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  24.56 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  22.83 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  29.25 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  23.78 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.23 
 
 
198 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  24.3 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  29.7 
 
 
350 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  29.41 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  27.59 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  30.84 
 
 
234 aa  42.7  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  28.45 
 
 
279 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  28.7 
 
 
244 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  31.18 
 
 
210 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  32.53 
 
 
208 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>