More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0020 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  100 
 
 		 315 aa  615  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  57.2 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  58.66 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  54.14 
 
 		 292 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  53.9 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  45.45 
 
 		 292 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  49.83 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  49.81 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  45.7 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  44 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  44 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  44 
 
 		 289 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  43.77 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  53.81 
 
 		 238 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  50.2 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  41.54 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  40.81 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  44.09 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  43.68 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  39.27 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  42.11 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  43.99 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  41.88 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  44.03 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  40.32 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  37.45 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  37.72 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  36.94 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  39.8 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  41.24 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  35.39 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  39.54 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  38.43 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  35.69 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  34.16 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  42.18 
 
 		 201 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  32.78 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.78 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  35.92 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.06 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  32.17 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  37.75 
 
 		 376 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  28.51 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  39.29 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  37.09 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  39.1 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  35.47 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.89 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 579 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  31.16 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  40.77 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.58 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  34.16 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  28.38 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  35.93 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  31.28 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  35.1 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  36.18 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.39 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  33.51 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  36.24 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  38.69 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  31.35 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  38.97 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  36.97 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  35.22 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  37.58 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  31.82 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  31.17 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  33.16 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  31.14 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  41.76 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  35.15 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  38.89 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  34.23 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  34.21 
 
 		 556 aa  70.5  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  34.76 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  29.02 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  30 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  36.67 
 
 		 569 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  30.15 
 
 		 273 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  33.12 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  33.33 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  28.71 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  27.65 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  37.24 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  29.49 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  29.49 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  35.48 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  30.95 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  36.9 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  29.65 
 
 		 360 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  33.6 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  29.15 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  30.95 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  29.21 
 
 		 232 aa  67  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  30.93 
 
 		 205 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  26.55 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>