84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_A66 on replicon NC_011784
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  47.76 
 
 
266 aa  257  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  43.64 
 
 
293 aa  202  5e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  37.02 
 
 
292 aa  193  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  38.62 
 
 
310 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  38.91 
 
 
318 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  38.72 
 
 
305 aa  185  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  38.62 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  37.4 
 
 
310 aa  178  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  39.15 
 
 
284 aa  176  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  35.58 
 
 
316 aa  174  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  41.07 
 
 
220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  40.62 
 
 
220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  35.69 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  39.91 
 
 
233 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  35.23 
 
 
325 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  39.04 
 
 
229 aa  163  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  39.41 
 
 
261 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  37.67 
 
 
228 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.48 
 
 
313 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  35.24 
 
 
233 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.61 
 
 
279 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  29.91 
 
 
243 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  29.46 
 
 
235 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.77 
 
 
266 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.77 
 
 
280 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  29.68 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  30.64 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  30.64 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  28.24 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  28.24 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  30.32 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  28.65 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  30.59 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.47 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.58 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.79 
 
 
195 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.68 
 
 
228 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  27 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.35 
 
 
218 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  25.11 
 
 
228 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  24.14 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  23.74 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  25.99 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.11 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.99 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.8 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  25.93 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  27.56 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.96 
 
 
195 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.99 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.96 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  24.18 
 
 
216 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  26.39 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  25.11 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.22 
 
 
226 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  24.07 
 
 
232 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.36 
 
 
249 aa  52.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  24.73 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.04 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  24.2 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.99 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.06 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  22.9 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  28.1 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  23.28 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  25.49 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  23.74 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.6 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  24.77 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  24.28 
 
 
191 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  24.67 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.48 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  24.36 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  23.67 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K25  hypothetical protein  40 
 
 
57 aa  44.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.432781  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  25 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  24.36 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  25 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.21 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  24.51 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  23.56 
 
 
232 aa  42.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.17 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.38 
 
 
226 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>