59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0837 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0837  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  838    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00840057  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  25.59 
 
 
377 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.83 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  21.04 
 
 
480 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  19.46 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  25.1 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  20.38 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  30.58 
 
 
1153 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  35.96 
 
 
400 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  24.9 
 
 
395 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  17.76 
 
 
792 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  19.76 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  19.81 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.91 
 
 
401 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  31.78 
 
 
359 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  20.77 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  20 
 
 
362 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  23.39 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25.95 
 
 
360 aa  53.5  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  27.68 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.12 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  19.57 
 
 
388 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  25.57 
 
 
1111 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  23.12 
 
 
483 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.12 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  28.07 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.02 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.13 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  18.85 
 
 
359 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.57 
 
 
418 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  33.71 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  29.7 
 
 
1061 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  18.37 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  29.7 
 
 
1061 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  32.58 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  21.05 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  18.13 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  26.4 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 
481 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  20.75 
 
 
386 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  17.4 
 
 
443 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  27.05 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  17.99 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  20.29 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  20.09 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  27.03 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 
495 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 
358 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  19.16 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  21.81 
 
 
478 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.88 
 
 
382 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 
498 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 
382 aa  43.1  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0497689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>