More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0672 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0672  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 586 aa  1172    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0681  preprotein translocase subunit SecD  38.02 
 
 		 587 aa  357  5e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  34.62 
 
 		 503 aa  270  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  36.87 
 
 		 532 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.71 
 
 		 531 aa  243  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36 
 
 		 856 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  35.17 
 
 		 533 aa  238  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  33.82 
 
 		 530 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  38.48 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  33.5 
 
 		 594 aa  232  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  33.5 
 
 		 594 aa  232  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  33.74 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  35.09 
 
 		 533 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  33.41 
 
 		 533 aa  230  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  32.95 
 
 		 594 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  31.48 
 
 		 532 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.79 
 
 		 853 aa  228  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  32.6 
 
 		 535 aa  228  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  31.66 
 
 		 595 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  32.86 
 
 		 843 aa  226  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  33.66 
 
 		 533 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.07 
 
 		 530 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.44 
 
 		 740 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  34.44 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  32.45 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  33.5 
 
 		 533 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  32.33 
 
 		 406 aa  224  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  33.99 
 
 		 532 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  33.08 
 
 		 531 aa  224  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 530 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.82 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  30.87 
 
 		 473 aa  221  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  32.36 
 
 		 531 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  33.1 
 
 		 533 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  34.34 
 
 		 533 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.24 
 
 		 487 aa  220  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  33.41 
 
 		 554 aa  219  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  38.11 
 
 		 622 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  32.87 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  34.53 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  34.66 
 
 		 537 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  32.54 
 
 		 526 aa  217  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  33.09 
 
 		 532 aa  217  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  33.48 
 
 		 759 aa  217  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  32.32 
 
 		 532 aa  217  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  30.6 
 
 		 607 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  34.57 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  31.7 
 
 		 613 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  32.75 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  31.88 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  31.2 
 
 		 556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  32.75 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.79 
 
 		 762 aa  215  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  39.55 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  34.82 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.26 
 
 		 849 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  31.92 
 
 		 613 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  31.44 
 
 		 554 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  33.41 
 
 		 529 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.78 
 
 		 848 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  32.37 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.89 
 
 		 839 aa  213  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  34.55 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.45 
 
 		 856 aa  212  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  34.35 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  32.36 
 
 		 461 aa  210  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  34.35 
 
 		 521 aa  209  8e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  33.16 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  31.28 
 
 		 534 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  30.87 
 
 		 533 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  33.8 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  32.85 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  30.65 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.42 
 
 		 834 aa  207  5e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  32.93 
 
 		 554 aa  207  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  31.05 
 
 		 470 aa  207  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  32.92 
 
 		 512 aa  207  6e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  32.25 
 
 		 532 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  33.95 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  33.75 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  30.98 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  31.71 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  32.28 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  31.3 
 
 		 495 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  32.27 
 
 		 471 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  31.03 
 
 		 534 aa  204  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  33.25 
 
 		 534 aa  203  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.84 
 
 		 995 aa  202  9e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  31.7 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  32.1 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  32.04 
 
 		 632 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1572  preprotein translocase subunit SecD  33.02 
 
 		 616 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000232578  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  31.8 
 
 		 632 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2785  preprotein translocase subunit SecD  32.79 
 
 		 616 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000401853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2805  preprotein translocase subunit SecD  32.79 
 
 		 616 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000153559  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  29.19 
 
 		 616 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>