More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0663 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  100 
 
 
279 aa  538  9.999999999999999e-153  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  37.41 
 
 
291 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  33.69 
 
 
292 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  37.14 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  35.14 
 
 
292 aa  178  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  34.42 
 
 
283 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.08 
 
 
285 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  35.61 
 
 
278 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  33.69 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  34.66 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  34.18 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  36.17 
 
 
281 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  34.05 
 
 
294 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  34.05 
 
 
294 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  36.17 
 
 
281 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  35.13 
 
 
279 aa  169  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  31.77 
 
 
283 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  32 
 
 
288 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  32.63 
 
 
284 aa  168  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  33.46 
 
 
310 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  32.73 
 
 
287 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  36.88 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  33.46 
 
 
313 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  34.29 
 
 
283 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  31 
 
 
271 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  32.85 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  32.01 
 
 
296 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  32.01 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  31.99 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  32.72 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  32.01 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  32.01 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  28.52 
 
 
284 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
313 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  31.65 
 
 
296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  32.6 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  31.65 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  31.65 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  31.29 
 
 
296 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  31.65 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  31.65 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  32.72 
 
 
313 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  32.72 
 
 
313 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  32.72 
 
 
313 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  32.72 
 
 
313 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  33.33 
 
 
271 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
313 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  30.69 
 
 
284 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  30.77 
 
 
307 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
312 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
312 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  32.49 
 
 
284 aa  159  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  31.39 
 
 
313 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  30.69 
 
 
319 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  30.69 
 
 
319 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  33.57 
 
 
323 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  32.49 
 
 
282 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.27 
 
 
298 aa  156  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  30.29 
 
 
314 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
334 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 
283 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  29.82 
 
 
314 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  32.97 
 
 
281 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  29.37 
 
 
280 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  31.14 
 
 
328 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  31.65 
 
 
290 aa  152  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  29.93 
 
 
314 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  27.52 
 
 
319 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  30.04 
 
 
299 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  32.72 
 
 
312 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  30.04 
 
 
299 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  28.83 
 
 
277 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  31.87 
 
 
314 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1018  GTPase  31.27 
 
 
282 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.447609  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  31.36 
 
 
315 aa  150  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  30.04 
 
 
330 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 
311 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  29.75 
 
 
322 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  28.99 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  31.25 
 
 
279 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  27.53 
 
 
292 aa  145  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  29.24 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  27.51 
 
 
270 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  32.08 
 
 
323 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  28.88 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  28.1 
 
 
305 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  29.24 
 
 
316 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  30.6 
 
 
281 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  28.42 
 
 
320 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  28.21 
 
 
307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  35.16 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  27.86 
 
 
293 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  28.27 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  28.21 
 
 
341 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  31.11 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  31.11 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  29.5 
 
 
281 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>