299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0639 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0041  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000202293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0039  tRNA-Met  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0040  tRNA-Met  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0666979  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0024  tRNA-Met  86.57 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0004  tRNA-Met  97.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0023  tRNA-Met  94.59 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000976194  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0027  tRNA-Met  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.800046  normal  0.352894 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0048  tRNA-Met  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565374  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-1  tRNA-Met  86.67 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0953883  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  96.88 
 
 
77 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0036  tRNA-Met  86.67 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000218585  hitchhiker  0.0000000000151476 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09720  tRNA-Met  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000962233  hitchhiker  0.0000117108 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0005  tRNA-Met  93.94 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0018  tRNA-Met  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0053  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0038  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000704091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0045  tRNA-Met  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000395206  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0043  tRNA-Met  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50689  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0045  tRNA-Met  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0074  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt016  tRNA-Ile  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0037  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000950191  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0073  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000819508  normal  0.0429545 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2045  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0005  tRNA-Met  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0660  tRNA-Ile  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.834568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet03  tRNA-Met  100 
 
 
80 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00892587  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0071  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000012956  normal  0.0431401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  93.75 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0064  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00446845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0115  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.791558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t33  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.332244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t38  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00741229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt14  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.033496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t023  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t039  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t040  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0081  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183039  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0013  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.059772  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0036  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0559117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0052  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0057  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0079  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0663805  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0084  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0193203  normal  0.0545316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0061  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0062  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.202264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  93.55 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0071  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.741425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0043  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0486  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.212105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0111  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0109  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  93.55 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0062  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0022  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0047  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0087743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1793  tRNA-Ile  100 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00299619  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1585  tRNA-Ile  100 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1021  tRNA-Ile  100 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0085  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0569302  hitchhiker  0.00000332622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0086  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236197  normal  0.0136376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0087  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0055  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0032  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0772174  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0067  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.325907  normal  0.0460929 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0019  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0011  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>