75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0624 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0624  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00406719  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0172  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.678062  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0028  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0032  tRNA-Arg  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0018  tRNA-Arg  90.38 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0084  tRNA-Arg  86.76 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000144766  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0022  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  88.89 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0036  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.269516  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0004  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  88.52 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1223  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0782259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  85.94 
 
 
77 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000631385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0057  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0970774  normal  0.768528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0058  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06510  tRNA-Arg  88.46 
 
 
76 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000338303  normal  0.349036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0059  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0059  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0026  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.198088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  88.14 
 
 
76 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0039  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364679  normal  0.784144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA46  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198158  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0041  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.335788  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0050  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000388549  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_R0070  tRNA-Arg  88 
 
 
78 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143256  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  88 
 
 
76 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0010  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1416  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0016  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000514764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0069  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0196822  normal  0.911508 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2217  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  86.54 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4297  tRNA-Arg  85 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.801361  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0017  tRNA-Arg  86.54 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.915469  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0016  tRNA-Arg  85 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.448611  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.54 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000427256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0022  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000850812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0032  tRNA-Arg  84.13 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.191014  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0028    84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197769  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  84.75 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0018  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  0.24905 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0022  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000177446  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0032  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163942  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  88.1 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0034  tRNA-Arg  88.1 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.904479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0001  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383152  normal  0.0513953 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0037  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000022611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0042  tRNA-Trp  86.21 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264389  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0028  tRNA-Trp  86.21 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1683  tRNA-Arg  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.792102  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0001  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0771  tRNA-Arg  84.48 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>