More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0489 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
210 aa  208  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 
210 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 
210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 
210 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 
210 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 
210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 
210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 
210 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 
210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 
210 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  50.99 
 
 
210 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  50.99 
 
 
210 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 
211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 
211 aa  194  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
210 aa  194  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0767  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 
208 aa  193  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 
207 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  46.38 
 
 
219 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 
207 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 
208 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 
223 aa  193  2e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 
212 aa  192  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 
211 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  48.57 
 
 
211 aa  191  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  49.07 
 
 
220 aa  191  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  47 
 
 
213 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 
243 aa  188  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 
218 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 
238 aa  187  9e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  45.97 
 
 
218 aa  187  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 
219 aa  187  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  46.73 
 
 
220 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  46.6 
 
 
219 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  46.6 
 
 
213 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 
212 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 
212 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
209 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 
218 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  48.13 
 
 
220 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 
209 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 
217 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 
209 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 
209 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  48.31 
 
 
214 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 
209 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
209 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  45.41 
 
 
222 aa  184  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 
208 aa  184  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 
205 aa  184  9e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  48.82 
 
 
212 aa  184  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 
216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  47.85 
 
 
212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  46.38 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  45.93 
 
 
209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 
210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  48.56 
 
 
217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  44.5 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
213 aa  181  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  48.31 
 
 
208 aa  181  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 
217 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  44.93 
 
 
209 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 
217 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  46.34 
 
 
228 aa  180  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 
217 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  47.62 
 
 
212 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 
214 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 
212 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 
216 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  44.93 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  46.19 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  47.12 
 
 
212 aa  178  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 
211 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  45.77 
 
 
206 aa  178  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 
290 aa  178  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  46.41 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 
212 aa  177  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  44.93 
 
 
226 aa  177  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 
212 aa  177  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 
205 aa  177  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  45.93 
 
 
209 aa  177  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
209 aa  177  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  46.89 
 
 
216 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  43 
 
 
219 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  46.12 
 
 
219 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 
216 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 
219 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
214 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 
216 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>