More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0442 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  57.73 
 
 
640 aa  684    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  51.5 
 
 
637 aa  648    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  55.28 
 
 
644 aa  698    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  52.61 
 
 
642 aa  647    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  51.01 
 
 
661 aa  636    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  57.66 
 
 
640 aa  683    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  54.73 
 
 
654 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  58.84 
 
 
638 aa  739    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  54.4 
 
 
644 aa  703    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  54.5 
 
 
643 aa  664    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  57.89 
 
 
640 aa  684    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  53.31 
 
 
651 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  58.54 
 
 
635 aa  689    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 
650 aa  650    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  51.49 
 
 
643 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 
645 aa  661    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  57.73 
 
 
640 aa  684    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  56.31 
 
 
642 aa  686    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  57.73 
 
 
640 aa  684    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  52.1 
 
 
645 aa  638    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  52.88 
 
 
645 aa  671    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  52.7 
 
 
655 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  57.73 
 
 
640 aa  685    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  53.14 
 
 
652 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  54.29 
 
 
642 aa  644    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  56.87 
 
 
642 aa  699    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  52.97 
 
 
642 aa  651    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  52.86 
 
 
655 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  53.05 
 
 
636 aa  669    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  56.8 
 
 
633 aa  711    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  51.16 
 
 
641 aa  637    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  55.45 
 
 
636 aa  723    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 
653 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  53.06 
 
 
650 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.33 
 
 
627 aa  665    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  57.66 
 
 
640 aa  682    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  56.06 
 
 
640 aa  680    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  55.19 
 
 
644 aa  673    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  52.7 
 
 
655 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  55.12 
 
 
637 aa  689    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  53.17 
 
 
655 aa  655    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  54.91 
 
 
637 aa  701    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  55.29 
 
 
635 aa  654    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  54.73 
 
 
640 aa  689    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  57.73 
 
 
640 aa  684    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  56.71 
 
 
640 aa  687    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  53.79 
 
 
640 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  54.19 
 
 
645 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  52.45 
 
 
642 aa  645    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  49.84 
 
 
636 aa  654    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  59.02 
 
 
633 aa  709    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  55.22 
 
 
634 aa  678    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  50.07 
 
 
665 aa  647    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  50 
 
 
675 aa  646    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
634 aa  1286    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  57.41 
 
 
640 aa  686    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  59.08 
 
 
641 aa  721    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  54.72 
 
 
643 aa  688    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  53.54 
 
 
635 aa  678    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.05 
 
 
636 aa  667    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 
632 aa  717    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  57.73 
 
 
640 aa  684    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  56.17 
 
 
638 aa  688    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  52.09 
 
 
655 aa  635    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  52.55 
 
 
655 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  52.68 
 
 
633 aa  636    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  53.79 
 
 
640 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  56.4 
 
 
637 aa  720    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  52.83 
 
 
644 aa  677    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  53.26 
 
 
648 aa  658    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  55.66 
 
 
649 aa  697    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 
652 aa  678    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  55.45 
 
 
638 aa  665    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  55.61 
 
 
638 aa  665    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  52.71 
 
 
648 aa  659    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  58.04 
 
 
650 aa  746    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  56.17 
 
 
633 aa  734    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  54.95 
 
 
645 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  52.24 
 
 
655 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  54.99 
 
 
651 aa  655    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  50.55 
 
 
647 aa  647    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  51.63 
 
 
644 aa  643    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  52.61 
 
 
642 aa  647    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  52.04 
 
 
646 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  55.99 
 
 
640 aa  726    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  52.59 
 
 
659 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  53.65 
 
 
650 aa  645    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  53.43 
 
 
658 aa  643    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  53.77 
 
 
649 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  55.7 
 
 
628 aa  732    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  52.44 
 
 
651 aa  667    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  51.39 
 
 
655 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  55.43 
 
 
644 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  57.82 
 
 
640 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  57.66 
 
 
649 aa  732    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  55.43 
 
 
643 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  53.44 
 
 
645 aa  660    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  54.27 
 
 
636 aa  652    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  52.7 
 
 
658 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  50.68 
 
 
656 aa  633  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>