117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0326 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  100 
 
 
377 aa  750    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  45.28 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  38.24 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 
358 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  43.1 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  46.51 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 
331 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  41.43 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 
242 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  43.14 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 
364 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  37.33 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  46.51 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  41.27 
 
 
377 aa  53.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  52.17 
 
 
167 aa  53.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  34.15 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 
546 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  44.64 
 
 
403 aa  53.1  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  50 
 
 
346 aa  53.1  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  40.32 
 
 
366 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  44.19 
 
 
390 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  36.23 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
420 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  42.55 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  51.11 
 
 
378 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 
374 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  44.44 
 
 
143 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 
374 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 
376 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 
376 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 
376 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  46.51 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 
376 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.67 
 
 
389 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  51.16 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 
389 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  37.04 
 
 
243 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  45.83 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  36.51 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  37.88 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 
572 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.83 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 
343 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  48.84 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  48.84 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  36.54 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  36.54 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  35.19 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  46.51 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  36.73 
 
 
663 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
338 aa  46.6  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  34.18 
 
 
334 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  39.66 
 
 
391 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
440 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 
440 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.19 
 
 
429 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
440 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  44.68 
 
 
345 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  44.68 
 
 
345 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  47.37 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  52.5 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  27.71 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  43.48 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  40 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  39.62 
 
 
161 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  38.78 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  32.65 
 
 
651 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  38.3 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  32.69 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  38.78 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.79 
 
 
155 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  38.89 
 
 
149 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  39.62 
 
 
161 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  44.19 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  44.19 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  30.16 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  39.53 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  38.3 
 
 
156 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  38.3 
 
 
156 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  36.17 
 
 
1051 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>