More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0196 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  719    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 360 aa  391  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  55.36 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  56.83 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 358 aa  381  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  54.23 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  53.08 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  52.91 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 360 aa  374  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  52.6 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  53.33 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.84 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  52.15 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  51.79 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  51.79 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  51.79 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  51.79 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  53.21 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  52.76 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  52.76 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  54.04 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  52.45 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  52.45 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  52.15 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  55.73 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  51.38 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  52.31 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  52.45 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  55.03 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  51.93 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  54.01 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  50.88 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  52.44 
 
 		 363 aa  366  1e-100  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133324  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  368  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  52.83 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  54.01 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1971  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00228451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  51.23 
 
 		 361 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>