More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0190 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  56.73 
 
 
175 aa  189  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  48.86 
 
 
225 aa  175  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  48 
 
 
238 aa  175  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
195 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
195 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
195 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
195 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 
219 aa  171  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 
166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 
166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
166 aa  168  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  43.33 
 
 
194 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 
194 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 
194 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  44.94 
 
 
202 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 
187 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.5 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
171 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 
171 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 
174 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 
230 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 
252 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 
232 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 
233 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  48.08 
 
 
176 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  50.31 
 
 
164 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 
165 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  50.7 
 
 
154 aa  158  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 
190 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  45.18 
 
 
179 aa  157  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  47.75 
 
 
229 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 
173 aa  157  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 
172 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 
173 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
164 aa  156  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 
172 aa  156  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 
198 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 
219 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  50.75 
 
 
137 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 
201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  45.25 
 
 
190 aa  154  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  45.78 
 
 
207 aa  154  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 
173 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 
192 aa  154  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  50.69 
 
 
145 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 
171 aa  153  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 
173 aa  153  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 
204 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 
175 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  48.59 
 
 
146 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 
199 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  43.79 
 
 
243 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  43.43 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 
196 aa  151  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  43.64 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 
178 aa  150  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  50 
 
 
173 aa  150  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  44.24 
 
 
238 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  44.24 
 
 
238 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  43.86 
 
 
178 aa  150  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  44.16 
 
 
154 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  48.94 
 
 
178 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  44.24 
 
 
238 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 
173 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  51.79 
 
 
173 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  43.64 
 
 
243 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 
176 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  43.89 
 
 
183 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  41.11 
 
 
205 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 
169 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 
182 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 
182 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  43.89 
 
 
183 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  45.18 
 
 
177 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  43.89 
 
 
183 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 
173 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  44.38 
 
 
225 aa  148  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 
173 aa  148  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  44.74 
 
 
181 aa  148  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 
277 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  42.29 
 
 
171 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 
156 aa  147  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 
173 aa  147  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  43.98 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  41.71 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  45.35 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  47.18 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 
204 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  40.57 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  42.13 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>