More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0113 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  58.75 
 
 
89 aa  99  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  66.15 
 
 
78 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  59.38 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  63.08 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
80 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
80 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
80 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  61.54 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  65.57 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  60.94 
 
 
74 aa  84.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  61.19 
 
 
75 aa  84.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  62.32 
 
 
74 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  47.31 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  59.42 
 
 
74 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  60.29 
 
 
74 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  60.87 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  56.76 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  56.76 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1459  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0449  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 
73 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000993889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  44.32 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  51.25 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  66.67 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  56.52 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  56.72 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  69.81 
 
 
65 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  56.72 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  53.25 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  63.64 
 
 
78 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  56.92 
 
 
71 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 
76 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  61.67 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  58.46 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  72 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 
71 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  63.33 
 
 
76 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  59.09 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  60.32 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  43.75 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2779  30S ribosomal protein S18  69.23 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000612799  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 
76 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.752864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>