More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0099 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 
307 aa  614  1e-175  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.51 
 
 
319 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.6 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  38.49 
 
 
342 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38 
 
 
293 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.25 
 
 
306 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  38.94 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  38.77 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  38.05 
 
 
337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  38.94 
 
 
354 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  38.94 
 
 
354 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  39.38 
 
 
354 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  38.94 
 
 
354 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  38.94 
 
 
354 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  35.62 
 
 
315 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  37.61 
 
 
352 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  36.4 
 
 
319 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  38.94 
 
 
354 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  38.94 
 
 
354 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  36.28 
 
 
354 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  38.94 
 
 
340 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.89 
 
 
291 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.11 
 
 
316 aa  158  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  37.68 
 
 
315 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.42 
 
 
295 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 
353 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.42 
 
 
293 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  37.05 
 
 
347 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.36 
 
 
350 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  38.36 
 
 
350 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  35.47 
 
 
332 aa  155  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  37.93 
 
 
350 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  37.93 
 
 
350 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  37.93 
 
 
350 aa  155  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  37.93 
 
 
350 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  37.93 
 
 
350 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  37.93 
 
 
350 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  37.5 
 
 
350 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.73 
 
 
319 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  37.07 
 
 
350 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  37.07 
 
 
350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  37.07 
 
 
350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  35.17 
 
 
293 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  35.17 
 
 
293 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  34.04 
 
 
293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  37.07 
 
 
350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  35.17 
 
 
293 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  35.17 
 
 
293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  37.07 
 
 
350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  34.04 
 
 
293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  34.09 
 
 
293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  33.62 
 
 
293 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  33.62 
 
 
293 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
293 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  33.62 
 
 
293 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.38 
 
 
319 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.44 
 
 
322 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  37.55 
 
 
352 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  33.19 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.96 
 
 
375 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.55 
 
 
288 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  32.01 
 
 
343 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  37.19 
 
 
349 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  37.28 
 
 
350 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 
293 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  36.28 
 
 
351 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.65 
 
 
294 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  32.14 
 
 
343 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  34.96 
 
 
349 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 
353 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  31.91 
 
 
314 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  33.47 
 
 
343 aa  149  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 
325 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  36.91 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  32.96 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  36.04 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  37.99 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.59 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  29.58 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  32.08 
 
 
344 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.78 
 
 
318 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.71 
 
 
300 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  31.65 
 
 
343 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.78 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  35.39 
 
 
349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.2 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  31.32 
 
 
351 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  32.14 
 
 
343 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  31.79 
 
 
343 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  35.93 
 
 
351 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  31.79 
 
 
343 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  33.19 
 
 
289 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  35.99 
 
 
312 aa  143  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.78 
 
 
296 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 
350 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 
350 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  35.11 
 
 
350 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.47 
 
 
290 aa  142  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  30.2 
 
 
289 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>