More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0062 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  100 
 
 
117 aa  237  3e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  45.45 
 
 
169 aa  115  2e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  36.08 
 
 
105 aa  80.5  7e-15  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  38.64 
 
 
131 aa  79.7  1e-14  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  35.79 
 
 
107 aa  79.3  2e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  9.46631e-06  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  32.17 
 
 
107 aa  78.6  3e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  32.17 
 
 
107 aa  78.6  3e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  77.8  4e-14  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  33.33 
 
 
103 aa  77.8  5e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  39.51 
 
 
154 aa  77.4  6e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  45.71 
 
 
285 aa  77.4  7e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  33.7 
 
 
113 aa  77  8e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  34.07 
 
 
107 aa  77  8e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  77  8e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  34.07 
 
 
107 aa  77  8e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  47.06 
 
 
105 aa  76.6  9e-14  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  36.17 
 
 
110 aa  76.6  9e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  46.27 
 
 
286 aa  76.6  9e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  44.12 
 
 
318 aa  76.6  1e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  31.43 
 
 
109 aa  76.6  1e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.1281e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  41.25 
 
 
285 aa  76.3  1e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  31.87 
 
 
107 aa  76.3  1e-13  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  44.12 
 
 
326 aa  76.6  1e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  34.48 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  42.68 
 
 
106 aa  75.5  2e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  32.38 
 
 
105 aa  75.5  2e-13  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  30.53 
 
 
109 aa  75.9  2e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  30.77 
 
 
107 aa  74.7  4e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  30.77 
 
 
124 aa  74.7  4e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  31.4 
 
 
108 aa  74.7  4e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  5.61264e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  42.65 
 
 
302 aa  74.7  4e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  41.18 
 
 
302 aa  74.7  4e-13  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  41.18 
 
 
302 aa  74.3  5e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  35 
 
 
110 aa  74.3  5e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  41.18 
 
 
302 aa  74.3  5e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  41.67 
 
 
287 aa  74.3  5e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  44.12 
 
 
341 aa  74.3  5e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  46.88 
 
 
106 aa  74.3  5e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  38.2 
 
 
127 aa  74.3  5e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  46.27 
 
 
105 aa  74.3  5e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  46.27 
 
 
105 aa  74.3  5e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  28.87 
 
 
106 aa  74.3  5e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  39.06 
 
 
107 aa  74.3  6e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  39.06 
 
 
107 aa  74.3  6e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  39.06 
 
 
107 aa  74.3  6e-13  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  48.39 
 
 
117 aa  73.9  6e-13  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  39.06 
 
 
107 aa  74.3  6e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  40.3 
 
 
102 aa  74.3  6e-13  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  9.42681e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  40 
 
 
290 aa  73.9  6e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  34.52 
 
 
106 aa  73.9  6e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.83291e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  41.18 
 
 
149 aa  73.9  7e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  35.16 
 
 
287 aa  73.6  8e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  31.65 
 
 
108 aa  73.6  8e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  31.68 
 
 
105 aa  73.6  9e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  34.69 
 
 
140 aa  73.2  1e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  33.33 
 
 
125 aa  73.6  1e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  37.97 
 
 
107 aa  73.2  1e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  39.53 
 
 
120 aa  73.2  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  37.93 
 
 
104 aa  73.2  1e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  40.85 
 
 
107 aa  73.2  1e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  34.88 
 
 
109 aa  73.2  1e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  46.55 
 
 
105 aa  72.8  1e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  27.37 
 
 
107 aa  72.8  1e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  27.37 
 
 
107 aa  72.8  1e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  33.01 
 
 
109 aa  73.2  1e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33356  thioredoxin y  32.29 
 
 
178 aa  73.6  1e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00024318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  29.47 
 
 
107 aa  72.8  1e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  37.08 
 
 
105 aa  72.4  2e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  43.08 
 
 
140 aa  72.4  2e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.56365e-10 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  34.48 
 
 
105 aa  72  2e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  34.12 
 
 
109 aa  72.4  2e-12  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  34.48 
 
 
150 aa  72  2e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  38.57 
 
 
290 aa  72.8  2e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  32.95 
 
 
105 aa  72.8  2e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  36 
 
 
125 aa  72.4  2e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  42.86 
 
 
133 aa  72.4  2e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  36.14 
 
 
119 aa  72  2e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  46.15 
 
 
88 aa  72.4  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  34.88 
 
 
106 aa  71.6  3e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  42.19 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  26.13 
 
 
147 aa  71.6  3e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  42.19 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  32.5 
 
 
108 aa  72  3e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  34.88 
 
 
108 aa  71.6  3e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  37.5 
 
 
110 aa  71.6  3e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  42.19 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  32.5 
 
 
108 aa  72  3e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  42.19 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  42.19 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  42.19 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.33 
 
 
148 aa  72  3e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  42.19 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  42.19 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  36.14 
 
 
119 aa  71.6  3e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  44.29 
 
 
285 aa  71.6  3e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  39.34 
 
 
287 aa  71.6  3e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  38.82 
 
 
104 aa  71.6  3e-12  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  42.19 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  39.71 
 
 
286 aa  71.2  4e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  34.48 
 
 
107 aa  71.6  4e-12  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>