More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0045 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  100 
 
 
181 aa  357  5e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50.84 
 
 
242 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0701  ribonuclease HII  46.11 
 
 
195 aa  147  6e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  39.46 
 
 
206 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  43.65 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  43.82 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  47.49 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  43.41 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  48.09 
 
 
216 aa  143  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  44.44 
 
 
203 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  43.41 
 
 
208 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  43.48 
 
 
191 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  40.76 
 
 
207 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  44.75 
 
 
198 aa  142  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.78 
 
 
206 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  42.93 
 
 
191 aa  140  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  40.56 
 
 
201 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  43.96 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  41.99 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  43.55 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  40 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  43.26 
 
 
199 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  37.36 
 
 
248 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  40.66 
 
 
207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  40.54 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  45.11 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  36.81 
 
 
248 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  42.31 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  43.78 
 
 
206 aa  137  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  44.2 
 
 
198 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  39.66 
 
 
208 aa  137  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  39.78 
 
 
218 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  42.08 
 
 
203 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  43.96 
 
 
208 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  40.86 
 
 
205 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  41.76 
 
 
213 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  41.75 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  40.11 
 
 
204 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  37.16 
 
 
217 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  37.16 
 
 
217 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  41.76 
 
 
202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  42.46 
 
 
250 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  41.76 
 
 
202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  42.46 
 
 
203 aa  134  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  40.56 
 
 
207 aa  134  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  42.63 
 
 
232 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  39.89 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  37.16 
 
 
210 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  37.36 
 
 
214 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  41.57 
 
 
216 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  42.46 
 
 
210 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  41.44 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  38.8 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  43.23 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  39.89 
 
 
227 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  41.44 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  36.81 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  35.71 
 
 
249 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  39.44 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  42.31 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  40.56 
 
 
207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  43.85 
 
 
211 aa  132  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  39.56 
 
 
218 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  40.33 
 
 
212 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  36.81 
 
 
214 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  36.81 
 
 
214 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  37.78 
 
 
210 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  44.2 
 
 
238 aa  131  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  44.2 
 
 
238 aa  131  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  38.92 
 
 
240 aa  131  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  39.34 
 
 
207 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  40 
 
 
207 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  40.33 
 
 
212 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  44.39 
 
 
209 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  38.33 
 
 
202 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  39.13 
 
 
215 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  39.23 
 
 
198 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  39.78 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  41.67 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  39.44 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  40.76 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  41.21 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  41.34 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  40.11 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  37.99 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  40.45 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  39.56 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  45.36 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  39.13 
 
 
198 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  42.25 
 
 
299 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  42.16 
 
 
214 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  40.76 
 
 
226 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  39.11 
 
 
229 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  41.4 
 
 
232 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1792  ribonuclease H  37.02 
 
 
216 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.862706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2801  ribonuclease HII  43.32 
 
 
209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  39.33 
 
 
229 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  42.22 
 
 
198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  39.66 
 
 
198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2128  Ribonuclease H  37.02 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.851112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>