More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0041 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0041  phosphate transport system regulatory protein PhoU  100 
 
 
223 aa  437  9.999999999999999e-123  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.660859  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  35.19 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  35 
 
 
219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.63 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  32.74 
 
 
221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  31.56 
 
 
217 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
218 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  30.7 
 
 
253 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.22 
 
 
228 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  30.41 
 
 
256 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 
256 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 
256 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 
256 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  29.73 
 
 
218 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.16 
 
 
225 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
242 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 
253 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.46 
 
 
247 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  30.23 
 
 
253 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  29.19 
 
 
239 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  30.67 
 
 
216 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  30.91 
 
 
239 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 
216 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 
215 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 
235 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  27.27 
 
 
229 aa  101  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  31.56 
 
 
217 aa  101  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 
235 aa  101  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  30.59 
 
 
218 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  29.67 
 
 
240 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  29.17 
 
 
238 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  29.17 
 
 
240 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  29.17 
 
 
240 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  30.85 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  31.25 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  29.03 
 
 
242 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  29.03 
 
 
242 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  29.19 
 
 
239 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  28.51 
 
 
243 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  29.63 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  29.55 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  26.34 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  27.49 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
237 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  28.05 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  28.05 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.84 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  30.77 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  27.78 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  27.03 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.14 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  27.6 
 
 
241 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  27.52 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.25 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.09 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  27.23 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 
236 aa  94.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  30.26 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  27.57 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  28.05 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  28.11 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  26.67 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  28.05 
 
 
243 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  28.05 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  31.69 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  30.7 
 
 
233 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 
243 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  27.15 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  28.11 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  28.76 
 
 
216 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  29.38 
 
 
236 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  28.1 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  28.18 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  29.55 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  28.31 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  26.7 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  26.7 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  26.7 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  26.7 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  26.7 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  28.31 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.1 
 
 
240 aa  92  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.1 
 
 
240 aa  92  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  27.31 
 
 
231 aa  92  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  28.3 
 
 
241 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  28.3 
 
 
241 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  29.32 
 
 
240 aa  92  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  29.33 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  27.6 
 
 
244 aa  91.7  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>