More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0035 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 
626 aa  1247    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  47.69 
 
 
703 aa  576  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  40.19 
 
 
846 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  38.17 
 
 
832 aa  458  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  37.97 
 
 
914 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  36.46 
 
 
708 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  39.21 
 
 
859 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  39.03 
 
 
906 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  38.33 
 
 
864 aa  439  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  39.04 
 
 
977 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.46 
 
 
697 aa  437  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  37.76 
 
 
897 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  36.79 
 
 
898 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  39.54 
 
 
904 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  40.09 
 
 
490 aa  362  2e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2787  DNA gyrase subunit A  37.68 
 
 
864 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124644  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  36.99 
 
 
923 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  36.42 
 
 
934 aa  211  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  36.42 
 
 
922 aa  210  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  32.04 
 
 
837 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  33.42 
 
 
822 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  36.07 
 
 
928 aa  205  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0958  DNA gyrase, A subunit  35.44 
 
 
869 aa  204  4e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.687987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0006  DNA gyrase, A subunit  35.66 
 
 
812 aa  204  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  30.67 
 
 
834 aa  203  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0040  DNA gyrase, A subunit  31.08 
 
 
876 aa  203  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  29.15 
 
 
899 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  34.46 
 
 
788 aa  201  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0873  DNA gyrase, A subunit  35.16 
 
 
899 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218975  hitchhiker  0.00000181562 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  32.72 
 
 
840 aa  201  3.9999999999999996e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  36.86 
 
 
927 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  29.98 
 
 
848 aa  200  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  34.72 
 
 
853 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  32.14 
 
 
840 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2557  DNA topoisomerase IV subunit A  33.88 
 
 
814 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  31.13 
 
 
872 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1286  DNA gyrase, A subunit  34.86 
 
 
873 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  35.56 
 
 
915 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  34.92 
 
 
809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0008  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.06 
 
 
836 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  33.43 
 
 
883 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1543  DNA gyrase subunit A  34.7 
 
 
930 aa  197  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.255758 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  37.28 
 
 
912 aa  198  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  35.63 
 
 
811 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  32.79 
 
 
834 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1610  DNA topoisomerase IV subunit A  33.24 
 
 
807 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.012204  hitchhiker  0.000000000671952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4667  DNA gyrase subunit A  35.8 
 
 
853 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  27.11 
 
 
839 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  35.13 
 
 
827 aa  197  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0640  DNA gyrase subunit A  34.62 
 
 
827 aa  197  7e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00358145  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  34.07 
 
 
883 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0007  DNA gyrase subunit A  30.68 
 
 
910 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3119  DNA gyrase subunit A  35.65 
 
 
914 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  35 
 
 
806 aa  196  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  34.46 
 
 
841 aa  196  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0658  DNA gyrase, A subunit  35.36 
 
 
830 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3284  DNA topoisomerase IV subunit A  33.24 
 
 
807 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  27.12 
 
 
839 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  35.43 
 
 
880 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0493  DNA gyrase subunit A  34.63 
 
 
900 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  28.26 
 
 
823 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  29.31 
 
 
875 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2151  DNA gyrase, A subunit  30.39 
 
 
834 aa  195  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000186517  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1724  DNA gyrase, A subunit  34.43 
 
 
928 aa  195  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0733273  normal  0.707795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  35.51 
 
 
809 aa  196  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0007  DNA gyrase subunit A  30.04 
 
 
885 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.743623  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  28.57 
 
 
823 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0004  DNA gyrase, A subunit  35.86 
 
 
856 aa  196  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1396  DNA gyrase subunit A  34.81 
 
 
877 aa  195  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.431905  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2024  DNA gyrase, A subunit  32.13 
 
 
841 aa  194  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3009  DNA gyrase subunit A  34.35 
 
 
878 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.354996  normal  0.0330044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  36.05 
 
 
856 aa  194  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  34.35 
 
 
882 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1315  DNA gyrase subunit A  34.63 
 
 
902 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000857491  decreased coverage  3.4629599999999997e-25 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2790  DNA gyrase subunit A  35.14 
 
 
889 aa  194  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0140578  hitchhiker  0.00260367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  28.26 
 
 
823 aa  194  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  30.17 
 
 
838 aa  194  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  35.55 
 
 
885 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3705  DNA topoisomerase IV subunit A  32.42 
 
 
807 aa  194  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00432189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  34.52 
 
 
805 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  28.26 
 
 
823 aa  194  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3607  DNA topoisomerase IV subunit A  32.42 
 
 
807 aa  194  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.01383e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  28.26 
 
 
823 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09151  DNA gyrase subunit A  35.71 
 
 
875 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.403302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  28.26 
 
 
823 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3616  DNA topoisomerase IV subunit A  32.42 
 
 
807 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0272621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  28.26 
 
 
823 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3391  DNA topoisomerase IV subunit A  32.42 
 
 
807 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  28.26 
 
 
823 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3354  DNA topoisomerase IV subunit A  32.42 
 
 
807 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00260467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3303  DNA topoisomerase IV subunit A  32.42 
 
 
807 aa  193  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3623  DNA topoisomerase IV subunit A  32.42 
 
 
807 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000210274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  28.26 
 
 
823 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3656  DNA topoisomerase IV subunit A  32.42 
 
 
807 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1072  DNA gyrase subunit A  35.05 
 
 
915 aa  193  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  34.96 
 
 
913 aa  193  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2464  DNA gyrase subunit A  34.53 
 
 
888 aa  193  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4719  DNA gyrase subunit A  34.25 
 
 
888 aa  193  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.902316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1166  DNA gyrase subunit A  35.08 
 
 
904 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0659198  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2494  DNA gyrase subunit A  34.6 
 
 
919 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  0.164499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>