More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0022 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0022  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
347 aa  699    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.74 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00218707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.46 
 
 
330 aa  359  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 
342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 
341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 
335 aa  355  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 
338 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 
341 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.63 
 
 
342 aa  352  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 
338 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 
338 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.92 
 
 
340 aa  350  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.63 
 
 
342 aa  348  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.38 
 
 
354 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.38 
 
 
356 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
340 aa  344  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.9 
 
 
361 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
355 aa  343  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 
346 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.03 
 
 
344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 
346 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
342 aa  342  7e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.1 
 
 
335 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.41 
 
 
354 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.88 
 
 
336 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.43 
 
 
334 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.52 
 
 
338 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
344 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.09 
 
 
343 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.05 
 
 
358 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.04 
 
 
336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.45 
 
 
357 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.45 
 
 
357 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  55 
 
 
338 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.77 
 
 
337 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.42 
 
 
355 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 
340 aa  339  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.69 
 
 
334 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.75 
 
 
357 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  51.11 
 
 
355 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 
340 aa  338  8e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 
338 aa  338  8e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.77 
 
 
337 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.8 
 
 
338 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0172  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.35 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.719394  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.59 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.8 
 
 
351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.8 
 
 
351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.09 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.77 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.09 
 
 
334 aa  335  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.09 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.09 
 
 
356 aa  335  5.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.76 
 
 
356 aa  335  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.76 
 
 
356 aa  335  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.64 
 
 
351 aa  335  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.15 
 
 
363 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  51.21 
 
 
341 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.69 
 
 
337 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1203  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.16 
 
 
345 aa  334  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.25 
 
 
345 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.31 
 
 
333 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.31 
 
 
333 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.63 
 
 
352 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 
334 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.56 
 
 
355 aa  333  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.6 
 
 
334 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.96 
 
 
334 aa  332  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 
334 aa  332  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.88 
 
 
336 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.36 
 
 
346 aa  332  5e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.6 
 
 
334 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.59 
 
 
340 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.59 
 
 
340 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.77 
 
 
354 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.13 
 
 
334 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.32 
 
 
334 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.6 
 
 
334 aa  332  6e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 
336 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.78 
 
 
336 aa  332  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.3 
 
 
348 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.55 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 
338 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 
333 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.13 
 
 
337 aa  332  8e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.37 
 
 
355 aa  332  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  49.22 
 
 
334 aa  332  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.09 
 
 
351 aa  332  8e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.58 
 
 
353 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.42 
 
 
340 aa  331  9e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.13 
 
 
334 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.78 
 
 
336 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.78 
 
 
336 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.78 
 
 
336 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  48.78 
 
 
336 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.13 
 
 
334 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.09 
 
 
337 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 
343 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>