More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0012 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0012  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  39.68 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2275  tRNA pseudouridine synthase A  42.63 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0551657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  39.27 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  39.09 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4567  tRNA pseudouridine synthase A  34.02 
 
 		 249 aa  161  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  34.43 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  34.43 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  36.84 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 		 261 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  34.96 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  36.95 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  36.63 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  36.14 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  36.55 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  35.74 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 		 261 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  37.19 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  36.93 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  36.21 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1259  tRNA pseudouridine synthase A  32.08 
 
 		 290 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  32.51 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  32.93 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 261 aa  148  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  34.73 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  34.73 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  34.69 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  34 
 
 		 248 aa  148  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  32.41 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  31.02 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  31.84 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1800  tRNA pseudouridine synthase A  34.3 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  33.61 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  33.88 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2123  tRNA pseudouridine synthase A  30.25 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.521479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  33.46 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  32.39 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  35.97 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  33.88 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  31.84 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  30.2 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  32.93 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.86 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4667  tRNA pseudouridine synthase A  35.29 
 
 		 284 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  28.98 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  31.71 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  35.15 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1368  tRNA pseudouridine synthase A  31.71 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01204  tRNA pseudouridine synthase A  31.43 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1380  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 243 aa  141  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  32.35 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  32.66 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  32.1 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1175  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.261971  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  30.52 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  32.52 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  29.8 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  30.52 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.46 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1337  tRNA pseudouridine synthase A  31.09 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.354676  normal  0.497364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  32.02 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  33.05 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  31.98 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  33.05 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  30.2 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  33.05 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>