12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6574 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6574  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6288  hypothetical protein  97.74 
 
 		 133 aa  227  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262335  normal  0.0206583 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  81.95 
 
 		 1004 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6537  hypothetical protein  87.97 
 
 		 133 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.383132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5500  hypothetical protein  78.95 
 
 		 133 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0769  hypothetical protein  58.49 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00282822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0781  hypothetical protein  58.49 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000646713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2029  hypothetical protein  35.25 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2186  hypothetical protein  32.54 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0337771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0457  hypothetical protein  29.51 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5488  hypothetical protein  31.06 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.271258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0082  hypothetical protein  33.64 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0238826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>