More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6573 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  62.89 
 
 		 650 aa  833    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  98.53 
 
 		 879 aa  1650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  70.31 
 
 		 669 aa  929    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  80.94 
 
 		 950 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  88.78 
 
 		 876 aa  1474    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  67.64 
 
 		 671 aa  913    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  80.94 
 
 		 962 aa  1015    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  71.25 
 
 		 678 aa  945    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  71.06 
 
 		 679 aa  938    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  70 
 
 		 680 aa  936    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  93.09 
 
 		 1004 aa  1459    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  92.74 
 
 		 879 aa  1600    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  79.06 
 
 		 974 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 882 aa  1743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  92.74 
 
 		 879 aa  1600    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  42.05 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  40.82 
 
 		 877 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  50.47 
 
 		 662 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  47.46 
 
 		 635 aa  595  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  51.96 
 
 		 615 aa  589  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  49.06 
 
 		 638 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  48.03 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  46.44 
 
 		 631 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  48.73 
 
 		 638 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  48.72 
 
 		 638 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  50.17 
 
 		 641 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  43.43 
 
 		 835 aa  572  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  46.84 
 
 		 637 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  53.07 
 
 		 641 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  42.16 
 
 		 843 aa  552  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  37.17 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  39.2 
 
 		 825 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  40.23 
 
 		 825 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  38.88 
 
 		 841 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  48.48 
 
 		 566 aa  525  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  38.59 
 
 		 840 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.57 
 
 		 825 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  43.19 
 
 		 853 aa  525  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  37.95 
 
 		 840 aa  522  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  42.35 
 
 		 661 aa  517  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  35.96 
 
 		 845 aa  515  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1992  cytochrome c oxidase, subunit I  40.11 
 
 		 844 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  45.56 
 
 		 743 aa  502  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  34.31 
 
 		 853 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  36.33 
 
 		 796 aa  477  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0564  cytochrome c oxidase subunit I type  39.66 
 
 		 840 aa  475  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  37.29 
 
 		 839 aa  476  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  40.73 
 
 		 620 aa  475  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  39.62 
 
 		 620 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  43.33 
 
 		 623 aa  475  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  39.62 
 
 		 611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  39.62 
 
 		 620 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  39.46 
 
 		 620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  39.46 
 
 		 620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  39.62 
 
 		 611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  39.46 
 
 		 620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  39.46 
 
 		 620 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  39.78 
 
 		 654 aa  469  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  39.46 
 
 		 620 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  35.14 
 
 		 806 aa  465  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  40.92 
 
 		 644 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  34.6 
 
 		 857 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  34.08 
 
 		 857 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  44.26 
 
 		 561 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  40.53 
 
 		 644 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  40.35 
 
 		 647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  40.35 
 
 		 647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  40.35 
 
 		 647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40.35 
 
 		 644 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40.25 
 
 		 644 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  40.35 
 
 		 644 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40.21 
 
 		 644 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  43.49 
 
 		 648 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  44.15 
 
 		 589 aa  455  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  39.78 
 
 		 620 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  41.61 
 
 		 619 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40.35 
 
 		 644 aa  452  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  43.53 
 
 		 605 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  40.07 
 
 		 644 aa  452  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  45.17 
 
 		 589 aa  452  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  41.76 
 
 		 878 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  43.47 
 
 		 581 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  43.67 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  44.21 
 
 		 644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  41.99 
 
 		 580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  43.16 
 
 		 587 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  41.64 
 
 		 575 aa  446  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  44.21 
 
 		 572 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  44.75 
 
 		 594 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  44.79 
 
 		 541 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  42.17 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  43.97 
 
 		 596 aa  446  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  34.17 
 
 		 818 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  43.31 
 
 		 585 aa  442  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  41.7 
 
 		 563 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  45.37 
 
 		 582 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  43.6 
 
 		 594 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  42.01 
 
 		 609 aa  439  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  45.16 
 
 		 567 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  44.7 
 
 		 560 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>