274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6536 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  100 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  99.68 
 
 		 308 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  90.61 
 
 		 308 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  90.61 
 
 		 308 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  90.61 
 
 		 308 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  90.31 
 
 		 291 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  79.87 
 
 		 302 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  82.18 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  79.55 
 
 		 302 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  74.03 
 
 		 308 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  72.73 
 
 		 298 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  72.04 
 
 		 305 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  72.95 
 
 		 298 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  73.14 
 
 		 298 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  70.28 
 
 		 299 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  70.28 
 
 		 299 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  70.28 
 
 		 299 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  72.08 
 
 		 287 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  69.93 
 
 		 299 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  73.31 
 
 		 295 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  69.02 
 
 		 299 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  66.54 
 
 		 273 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  62.18 
 
 		 300 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 300 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  61.68 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  41.46 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  41.43 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  41.49 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.62 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.62 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.62 
 
 		 283 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.62 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.62 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.62 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.62 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  38.28 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  40.56 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  40.21 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  40.21 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40.48 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  40.48 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  41.11 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  41.64 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  41.64 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  41.64 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  41.64 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  41.64 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  41.64 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  38.7 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  38.73 
 
 		 282 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  36.84 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  38.35 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  36.75 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  36.75 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  36.75 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  36.63 
 
 		 281 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  37.94 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  37.86 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  40.66 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.61 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  34.57 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  35.16 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  35.16 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  38.23 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  37.74 
 
 		 335 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  35.65 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  35.79 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.09 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  34.8 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.38 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  38.23 
 
 		 277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  38.23 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 289 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  36.04 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.038749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  34.97 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  36.54 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  39.57 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  34.31 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  36.46 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.03 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  34.44 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  38.1 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  36.99 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.86 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  35.92 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.17 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  38.16 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.59 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  36.26 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.6 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  33.77 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  37.06 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  36.18 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>