More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6478 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  38.29 
 
 		 4268 aa  724    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  44.63 
 
 		 6889 aa  914    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  47.74 
 
 		 1656 aa  1188    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  50.08 
 
 		 2103 aa  1117    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  38.52 
 
 		 4165 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  45.6 
 
 		 2762 aa  1169    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1474 aa  2975    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  37.05 
 
 		 2727 aa  700    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  32.15 
 
 		 3718 aa  595  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  45.71 
 
 		 2791 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  45.78 
 
 		 3337 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  43.36 
 
 		 725 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  43.36 
 
 		 725 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  33.64 
 
 		 3875 aa  555  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.79 
 
 		 3099 aa  549  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  43.1 
 
 		 1087 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  41.1 
 
 		 2997 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  44.65 
 
 		 611 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  45.08 
 
 		 4478 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  45.61 
 
 		 1337 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  45.94 
 
 		 1587 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  43.58 
 
 		 3176 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  32.5 
 
 		 4101 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  41.91 
 
 		 2333 aa  519  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  44.81 
 
 		 2162 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  43.2 
 
 		 3696 aa  516  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 		 991 aa  510  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  44.94 
 
 		 3099 aa  508  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  47.09 
 
 		 1144 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  50.16 
 
 		 3424 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  43.2 
 
 		 3676 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  43.8 
 
 		 602 aa  505  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.82 
 
 		 2880 aa  505  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  46.6 
 
 		 2232 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  42.32 
 
 		 3702 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  42.19 
 
 		 3693 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  42.19 
 
 		 3693 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  40.08 
 
 		 1208 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 		 2551 aa  499  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  46.27 
 
 		 592 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  41.89 
 
 		 3679 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  41.98 
 
 		 614 aa  495  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  41.79 
 
 		 1939 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  46.79 
 
 		 2230 aa  492  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  42.48 
 
 		 1876 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 5154 aa  493  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  34.31 
 
 		 2376 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  44.09 
 
 		 1580 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  44.09 
 
 		 1580 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  42.27 
 
 		 2820 aa  485  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  46.05 
 
 		 2477 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.99 
 
 		 950 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.33 
 
 		 1874 aa  483  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 2374 aa  483  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  44.27 
 
 		 596 aa  483  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  43.41 
 
 		 1580 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.4 
 
 		 1349 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  42.4 
 
 		 1349 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  41.17 
 
 		 1823 aa  476  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  39.51 
 
 		 1067 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  42.25 
 
 		 588 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 		 1828 aa  475  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40 
 
 		 1559 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.15 
 
 		 1559 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  38.5 
 
 		 1581 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  43.27 
 
 		 3130 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  42.14 
 
 		 3645 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  41.67 
 
 		 2053 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  45.37 
 
 		 3427 aa  462  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  44.71 
 
 		 2225 aa  462  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.2 
 
 		 1372 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  41.81 
 
 		 597 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  41.81 
 
 		 597 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  42.78 
 
 		 1819 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  40.43 
 
 		 1577 aa  453  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  43.33 
 
 		 586 aa  453  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  41.08 
 
 		 3449 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  45.83 
 
 		 4080 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  43.83 
 
 		 578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.88 
 
 		 1354 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  44.69 
 
 		 1806 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  44.41 
 
 		 1805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  41.29 
 
 		 2250 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  42.49 
 
 		 3781 aa  445  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  43.08 
 
 		 1822 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  39.17 
 
 		 897 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  44.64 
 
 		 3101 aa  446  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  42.36 
 
 		 3780 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  38.42 
 
 		 3252 aa  443  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  39.85 
 
 		 3111 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  43.22 
 
 		 608 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  40.25 
 
 		 4111 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  43.36 
 
 		 1812 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  42.49 
 
 		 2111 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  39.23 
 
 		 3930 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  41.56 
 
 		 579 aa  435  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.34 
 
 		 2604 aa  437  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  44.29 
 
 		 1190 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  44.29 
 
 		 1190 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.53 
 
 		 2890 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>